在历代医家中，清代王清任是邓铁涛研究最多的医家之一。早在1958年，他就将“清代王清任在临床医学上的贡献”研究结论在《中医杂志》上发表。邓铁涛首先肯定了王清任的革新精神，不泥古重实用，但他不接受王清任在解剖学方面的“改错”成果。他认为，王清任提出的“业医诊病先明脏腑，定论立方要明病之本源”，这一目的和观点是正确的，尤其“医家立言著书，必亲治其证，屡验方法，万无一失，方可传与后人”的想法和精神是值得发扬的，但受历史条件局限，王氏本想改前人之错，访验脏腑实体却并没有达到真切的程度。因此，邓铁涛认为王清任的主要贡献在于丰富了中医的治疗学，尤其是他创立的一系列活血化瘀的方子，确有疗效，实用价值很高，至今为临床所喜用。邓铁涛对王清任的系列活血化瘀方药做了深入研究和临床应用观察，发现又以补气祛瘀治法为特色之最，补气使用黄芪用量达到四两（120克）更是其创新之处。
之后，邓铁涛梳理了中医“祛瘀法”的学术源流，发表论文《祛瘀法及其应用》（1975年《新中医》），全面介绍中医传统“祛瘀法”的丰富内涵，强调了“气为血帅”的重要临床意义。但邓铁涛也发现，王清任并非中医“祛瘀法”的极限，诊治岭南地区的冠心病患者，机械应用王氏的方药难免“古方今病不相能”。
《医林改错》有气血理论及补气祛瘀治法，但未有论及“痰”的问题。邓铁涛结合岭南医学临床实践，创新性提出了“痰瘀相关”理论。岭南身处祖国南方滨海，土卑地薄，气候炎热，环境潮湿，人群身体禀赋多属气虚或气阴不足，临床所见，冠心病患者或有瘀血证候，或无瘀血证候，但“痰证”却普遍存在。那么，痰与瘀之间是否有联系呢？
研究生的课题研究结果，证明了邓铁涛的理论假说。实验研究提示，冠心病痰证患者的血液流变学检测指标也存在不同程度异常。治疗前后的临床观察研究表明，临床常用的益气除痰方药，对改善心血管疾病痰证患者的血液流动性、凝集性有帮助，治疗痰证总有效率为82%，非痰证为75%，提示益气除痰法治疗冠心病，无论是对痰证患者还是对非痰证患者均有一定疗效。研究结果支持益气除痰作为岭南地区治疗冠心病的主要法则。
邓铁涛“痰瘀相关”学说认为，痰和瘀都是人体津液的变化，两者既是病理性产物，同时又可以成为致病因素；痰是瘀的初期阶段，瘀是痰的进一步发展；痰多能瘀脉，聚瘀可凝痰，因此祛瘀可考虑除痰，除痰宜结合化瘀，或痰瘀同治。这是邓铁涛对中医传统“祛瘀法”的重要发展，并将其应用于指导高血压病、脑动脉硬化、心律失常、风湿性心脏病、肺源性心脏病等心脑血管疾病的防治。
邓铁涛认为冠心病、风湿性心脏病、高血压病多属中医本虚标实之证，标实强调痰、瘀二邪，治疗时重视兼治痰瘀。如冠心病，邓铁涛认为：“广东地处南方卑湿，至易聚湿生痰，故以心阳虚兼痰者最为多见。”“临证观察，冠心病患者一般以心阳虚而兼痰浊者为多见，到中后期或心肌梗死的患者，则以心阳（阴）虚兼血瘀或兼痰和瘀者为多见。因此对本病的治疗，比较着重于补气除痰；除痰是一个通法，与补气药同用，通补兼施，有利于心阳的恢复，故本病心阳虚型常用温胆汤加人参治疗。”又如风湿性心脏病，邓铁涛认为：“风湿性心脏病是以心阴虚及风湿重者为多见，常以生脉散益气养阴，用威灵仙、桑寄生、蒺藜、木瓜之属以疗风湿。若兼瘀则以丹参、红花、桃仁之类以祛瘀。”对高血压之辨治，邓铁涛列气虚痰浊一证，法主健脾益气，自拟赭决七味汤治疗，该方重用黄芪合六君子汤补气以除痰浊，配以赭石、决明子以降逆平肝。
